历史上，常州瞿氏宗祠有5处：木梳街大宗祠、石灰桥西宗祠、庙沿河城西宗祠、周线巷分祠、茭蒲巷分祠。现存一处，即城西宗祠。
1 木梳街大宗祠
大宗祠，又称南坛、南祠、西南大宗祠，位于怀南乡十九都二图，即今清潭路，属永红乡永红村，原址在今永红小学（原为朱家祠堂）西侧，坐北朝南，祠前原有上沟河，隔河为欧家田，祠基平田4.56亩。当年朱家祠堂与瞿大宗祠并立。解放后曾为光福乡政府所用，祠堂二进为光福乡大会堂。“文革”中废，今已不存。
2 石灰桥西宗祠
西宗祠，在西门外南沿河石灰桥下。又称斯馨公祠，以迁常始祖瞿兰之字命名。坐落怀南乡十九都二图，平田三分，划去八世董烈女牌坊坊基五厘。今南沿河有日辉里，即石灰里之雅化名。祠基遗址难觅。
3 庙沿河西宗祠
庙沿河西宗祠，亦即芝逵公祠，堂名华鄂堂。从石灰桥移建此处者。坐落在至城乡庙沿河芝逵公旧宅遗址，祠基1亩7分4厘9毫，另刘继香田单三厘。
咸丰十年石灰桥西祠被毁后，十三世立甫公与前族长毓滋公等议赎庙沿河芝逵公旧宅后进，暂妥宗祏（音石，指神主牌位），再三理值，不可得，讼之官，方准赎回。此后梅轩、印山、赓甫三公建造西祠，以此为基础。光绪戊戌重建，共建4进及东屋。建祠筹款，由立甫公“集捐于南分（即南祠、大宗祠）族人而不自引嫌，一视同仁”。在四川綦江任知县的十三世瞿朝宗字印山，“邮寄千金于赓甫公，嘱为凑集建祠之用”。又十三世瞿树铭字梅轩在沪经商数十年，捐巨款建祠有功，瞿氏宗谱卷三像赞特为重建西祠梅轩、印山、赓甫三公图象。梅轩印山系十三世宜列于先、赓甫为十四世，而印山官仅知县，赓甫为按察使，官位虽高仍列于后，可能在建祠捐款稍次于印山故。有人错误地认为西祠系瞿赓甫所建，甚至称为“赓甫专祠”，是由于未见到《瞿氏宗谱》误会所致。
4 周线巷分祠
谱称瞿氏二分宗祠，又名松岩公分祠，承启堂二分宗祠，即老二房内长房第七世松岩公祠。额曰“承启堂”。祠已废。
祠址在至城乡中右厢周线巷内，坐南朝北，基地三分五厘二毫。祭田91.7亩。乾隆二十五年（1760年）建成，经手人为静山、绿野二公。
始建二进，并置祠田20余亩，供春秋祭享及三里庵憬斋公墓祭扫。享堂供奉第七世松岩公及以下神位，春秋两祭。乾隆四十八年（1783年），由十世志盛字际唐元配江阴缪氏孺人，捐资独钜，翻造享堂三楹、内寝三楹以及门房厨房等，规模毕具。内寝供奉第七世松岩公元配刘孺人及其以下孺人神位。缪孺人守节抚孤，奉旨建坊旌表，内寝有匾额曰“清标彤管”，即为旌彰缪孺人。是时祭田共40亩有零。
5 茭蒲巷分祠
又名贞符公分祠，祠址茭蒲巷内中右厢，据谱载祠墓祭田有90亩。
贞符公即老二房一支内四房第七世受祯公，廷譔（季俞公）次子，字贞符，邑廪生，候选知县，《谱》有传，称公文章是以名世，才智足以亢宗。生子二，长庆闳，嗣受禔，次庆莘。公生于顺治丁亥四月十九日丑时，卒于康熙庚寅九月十四日，葬丹阳县十四都四图甲上大华村。
占位居中
